三江学院高等职业技术学院和继续教育学院实行两块牌子、一套班子的管理模式，在三江学院东校区办学，东校区坐落于南京市雨花台区花神大道128号。 高等职业技术学院成立于2002年，面向中等职业学校招收对口单招高等职业教育本、专科学生，我院的培养目标是为社会输送适应生产、建设、管理和服务第一线需要的，德、智、体、美等全面发展的技能型人才。
目前已招收十一届学生近5000人，现有在校学生2026人，校园面积30000余平方米。从2010年起，高职院招收五年一贯制专科学生转入本科学习。 三江学院1997年开始举办成人高等教育， 2009年4月更名为继续教育学院，负责全校的成人学历教育和非学历教育的归口管理工作。成人学历教育招收业余、函授本、专科学生，非学历教育三年多以来共开设了多类培训班，正在就理顺关系、加强职责、建立制度等方面不断努力。
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